Pythonのオープンソースライブラーを活用したコンテンツ(Python スクリプト)
・シンプルなものからある程度複雑な複合機能アプリの例です。カスタマイズは種々可能です。
・市販ソフトは親切設計で多機能ですが、必要機能が限られている場合など機能特化型のアプリとして

機能限定シンプルアプリ

分子軌道(HOMO-LUMO)表示アプリ

  • SMILES入力だけで分子のHOMO、LUMO軌道を表示(MMFF、HF/3-21gで構造最適化)
  • 化学構造描画用アプリやモジュールを使用しない簡単設計

データセット解析アプリ

  • データセット(CSV形式)を読み込み、化学構造(SMILESベース)をPCA解析
  • 目的変数のヒストグラムを表示

SMILESデータクリーナー

  • データセットを読み込み、SMILESデータの前処理(正規化、塩削除など)を実施
  • 前処理後ファイルをcsvファイルとして保存

前処理前データ

前処理後データ

量子化学計算アプリ(複合機能アプリ)

  • SMILESデータの入力だけで一連の量子化学計算を実施
  • 構造最適化、振動計算、軌道エネルギー計算を実施
  • 計算結果(HOMO、LUMO)を自動的にcsvファイルに保存
  • 計算結果の一例(csvファイル)